Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Fndc4Q3TR08 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms