Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CiartQ3TQ03 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms