Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms