Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
XylbQ3TNA1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms