Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc102aQ3TMW1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc102aQ3TMW1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms