Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3KNL4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3KNL4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3KNL4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3KNL4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3KNL4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3KNL4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms