Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Col24a1Q30D77 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms