Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gbp8Q2V6D6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbp8Q2V6D6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbp8Q2V6D6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms