Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp1aQ2LKU9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms