Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
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Shroom4Q1W617 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
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Shroom4Q1W617 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
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Shroom4Q1W617 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
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Shroom4Q1W617 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
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Shroom4Q1W617 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
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Shroom4Q1W617 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
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Shroom4Q1W617 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
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Shroom4Q1W617 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
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Shroom4Q1W617 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
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Shroom4Q1W617 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
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Shroom4Q1W617 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
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Shroom4Q1W617 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Shroom4Q1W617 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Shroom4Q1W617 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
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