Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Samd11Q1RNF8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd11Q1RNF8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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