Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd300lgQ1ERP8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms