Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VgfQ0VGU4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VgfQ0VGU4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VgfQ0VGU4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VgfQ0VGU4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VgfQ0VGU4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms