Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd12Q0VE29 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd12Q0VE29 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd12Q0VE29 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd12Q0VE29 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd12Q0VE29 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd12Q0VE29 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd12Q0VE29 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd12Q0VE29 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd12Q0VE29 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd12Q0VE29 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd12Q0VE29 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Samd12Q0VE29 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms