Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb8Q0VBD0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms