Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms