Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Lrriq1Q0P5X1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lrriq1Q0P5X1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Lrriq1Q0P5X1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lrriq1Q0P5X1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lrriq1Q0P5X1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lrriq1Q0P5X1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lrriq1Q0P5X1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lrriq1Q0P5X1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lrriq1Q0P5X1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lrriq1Q0P5X1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lrriq1Q0P5X1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrriq1Q0P5X1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lrriq1Q0P5X1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms