Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn2bQ0KL01 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms