Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Znf541Q0GGX2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf541Q0GGX2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf541Q0GGX2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms