Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cnnm1Q0GA42 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms