Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms