Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cass4Q08EC4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms