Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms