Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms