Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms