Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Col17a1Q07563 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC29■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col17a1Q07563 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms