Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms