Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrstQ06666 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrstQ06666 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrstQ06666 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrstQ06666 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SrstQ06666 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrstQ06666 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrstQ06666 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrstQ06666 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrstQ06666 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms