Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atf4Q06507 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atf4Q06507 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms