Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms