Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r236Q05A06 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms