Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox12Q04890 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sox12Q04890 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms