Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RelbQ04863 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RelbQ04863 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RelbQ04863 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RelbQ04863 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RelbQ04863 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RelbQ04863 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RelbQ04863 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RelbQ04863 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RelbQ04863 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RelbQ04863 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RelbQ04863 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RelbQ04863 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RelbQ04863 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RelbQ04863 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RelbQ04863 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RelbQ04863 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RelbQ04863 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms