Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tff2Q03404 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms