Protein–RNA interactions for Protein: Q03401

Crisp1, Cysteine-rich secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp1Q03401 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Crisp1Q03401 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Crisp1Q03401 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crisp1Q03401 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms