Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fgfr4Q03142 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgfr4Q03142 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fgfr4Q03142 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms