Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mmp11Q02853 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms