Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1sQ02789 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms