Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms