Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GscQ02591 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GscQ02591 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GscQ02591 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GscQ02591 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GscQ02591 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GscQ02591 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GscQ02591 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GscQ02591 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GscQ02591 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GscQ02591 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GscQ02591 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GscQ02591 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GscQ02591 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GscQ02591 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GscQ02591 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GscQ02591 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GscQ02591 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GscQ02591 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GscQ02591 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GscQ02591 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GscQ02591 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GscQ02591 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GscQ02591 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GscQ02591 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GscQ02591 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GscQ02591 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GscQ02591 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GscQ02591 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GscQ02591 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GscQ02591 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GscQ02591 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GscQ02591 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GscQ02591 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GscQ02591 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GscQ02591 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GscQ02591 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GscQ02591 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GscQ02591 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GscQ02591 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GscQ02591 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GscQ02591 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GscQ02591 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GscQ02591 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GscQ02591 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GscQ02591 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GscQ02591 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GscQ02591 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GscQ02591 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GscQ02591 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GscQ02591 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GscQ02591 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GscQ02591 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GscQ02591 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GscQ02591 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GscQ02591 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GscQ02591 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GscQ02591 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GscQ02591 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GscQ02591 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GscQ02591 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GscQ02591 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GscQ02591 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GscQ02591 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GscQ02591 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GscQ02591 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GscQ02591 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GscQ02591 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GscQ02591 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GscQ02591 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GscQ02591 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GscQ02591 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GscQ02591 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GscQ02591 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GscQ02591 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GscQ02591 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GscQ02591 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GscQ02591 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GscQ02591 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GscQ02591 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GscQ02591 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GscQ02591 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GscQ02591 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GscQ02591 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GscQ02591 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GscQ02591 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GscQ02591 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GscQ02591 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GscQ02591 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GscQ02591 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GscQ02591 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GscQ02591 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GscQ02591 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GscQ02591 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GscQ02591 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GscQ02591 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GscQ02591 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GscQ02591 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GscQ02591 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GscQ02591 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms