Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp39Q02525 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms