Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Muc1Q02496 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms