Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ascl1Q02067 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms