Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RykQ01887 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RykQ01887 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RykQ01887 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RykQ01887 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RykQ01887 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RykQ01887 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RykQ01887 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RykQ01887 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RykQ01887 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RykQ01887 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RykQ01887 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RykQ01887 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RykQ01887 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RykQ01887 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RykQ01887 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RykQ01887 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RykQ01887 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RykQ01887 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RykQ01887 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RykQ01887 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RykQ01887 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RykQ01887 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RykQ01887 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RykQ01887 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RykQ01887 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RykQ01887 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RykQ01887 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RykQ01887 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RykQ01887 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RykQ01887 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RykQ01887 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RykQ01887 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RykQ01887 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RykQ01887 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RykQ01887 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RykQ01887 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RykQ01887 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RykQ01887 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RykQ01887 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RykQ01887 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RykQ01887 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RykQ01887 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RykQ01887 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RykQ01887 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RykQ01887 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RykQ01887 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RykQ01887 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RykQ01887 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RykQ01887 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RykQ01887 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RykQ01887 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RykQ01887 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RykQ01887 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RykQ01887 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RykQ01887 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RykQ01887 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RykQ01887 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RykQ01887 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RykQ01887 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RykQ01887 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RykQ01887 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RykQ01887 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RykQ01887 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RykQ01887 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RykQ01887 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RykQ01887 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RykQ01887 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RykQ01887 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RykQ01887 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RykQ01887 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RykQ01887 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RykQ01887 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RykQ01887 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RykQ01887 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RykQ01887 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RykQ01887 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms