Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1cQ01815 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms