Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nme2Q01768 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms