Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms