Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sec23aQ01405 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms