Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Top2aQ01320 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms