Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Grin2bQ01097 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Grin2bQ01097 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms